מערכת WebMoney מספקת ביצוע עסקאות בזמן אמת באמצעות יחידות חשבונאות - WM. בקרת תנועה של יחידות אלה המשתמש (הלקוח) מבצע באמצעות תוכנית WM Keeper.
המערכת תומכת במספר סוגים של יחידות חשבונאות המאוחסנים בארנקים אלקטרוניים המתאימים:
WME - המקבילה של יורו ב E-ארנקים
WMZ - המקבילה של הדולר Z-הארנק
כדי להתחיל להשתמש במערכת WebMoney, צריכים פשוט להתקין במחשב את תוכנית WM Keeper ולהירשם במערכת.